54年前，高俊明牧師為了記念玉山神學書院設立20週年，曾寫下〈山上的花園〉禱告文：
我們在天上的父神，願祢使這烏雲籠罩的荒山幽谷，變成百花盛開的花園。那兒有，真理的花，公義的花，聖愛的花，信仰的花，盼望的花，安慰的花，和平的花，喜樂的花，勇氣的花，勝利的花，贖罪的花，復活的花，盛開著。願它的馨香流芳遍地，直到萬代。奉耶穌基督的名祈求，阿們！
「荒山幽谷」是當時玉神全院師生從慶豐搬遷到鯉魚潭時的真實光景。當時神學院全部的財產只裝滿一台小型鐵牛搬運車。但上主賜給台灣原住民宣教運動豐富的神學資產，必須用信心的眼光才能看到。
位在花蓮縣壽豐鄉鯉魚潭山坡上的「荒山幽谷」，是上主賜給台灣教會的「原住民神學花園」。高俊明牧師在禱文中，流露出台灣本土神學教育的信仰洞見，他開墾原住民神學教育的園地，首要目標是要在原住民宣教史中開出「真理的花朵」。神學教育必須要以宣揚基督道成肉身的十字架真理為根基，只有讓原住民族人經歷到基督復活的救贖大能，真實經歷生命的更新和部落的重建，才能在原住民族人中間開放出「公義的花朵」和「聖愛的花朵」。
過去74年來，透過台灣眾教會姊妹弟兄的關懷、參與和支持，用基督的愛心一起澆灌原住民神學教育的園地，綻放出「信仰的花，盼望的花，安慰的花，和平的花，喜樂的花……」。通過造就訓練原住民教會傳道者，支持部落及都會宣教的發展，共同見證台灣教會互為肢體，不分族群合一服事。
為著台灣基督長老教會529間原住民教會的需要，玉山神學院傳承了原住民神學花園的夢想，受託訓練在地歸信耶穌基督的族人成為上主工人，讓設立在部落、都市、鄉村和海邊的教會，都有在地的人與上主同工，在台灣這塊美麗的土地上設立基督的教會，牧養上主的羊群，讓台灣人領受耶穌基督十字架上的愛與救贖福音的恩典。
懇請眾教會以愛心支持原住民神學教育事工，培育出能夠體會原住民苦難，願意委身在原住民社會中服事的傳道者，延續原住民神學花園的夢，綻放出「勇氣的花，勝利的花，贖罪的花，復活的花。」
人的苦難在那裡，那裡就是上主臨在的地方，更是原住民神學教育努力要開墾的福音園地。
